Hráč se ujímá role agenta jménem Gabriel Logan, který je pověřen a nasazen vládou Spojených Států za účelem boje proti teroristickým aktivitám mezinárodního zločince Ericha Rhoemera, který ohrožuje Washington D.C. svými biologickými zbraněmi. V honbě za Rhoemerem se kromě USA Gabriel a jeho partner Lian Xing podívají až do Kazachstánu.
Syphon Filter je 3rd person akční hra, kde hráč má mimo standardní akční postup hrou také možnost zneškodňovat nepřátele potichu, stealth stylem. Během hraní se hráč orientuje díky radaru a střílí pomocí automatického lockování na nepřátele, některé zbraně mají navíc 1st person režim míření. V některých misích je pro postup dál nutno vyřešit různé hádanky.
@Rapier (08.01.2024 22:15): SONY ženského rodu zřejmě není. Jelikož : Název společnosti Sony vznikl spojením dvou slov „sonus“ a „sonny“. Slovo „sonus“ v latině představuje slovo zvuk. Druhé slovo „sonny“ znamená malý syn/ mladý muž. Mělo to vyjadřovat zaměření na audio výrobky a mladé lidi.