Na mimozemskou planetu havarovala kosmická loď. Přeživším havárie se stal Brotato, jediná brambora v galaxii schopná používat šest zbraní současně. Čekání na záchranný tým bude vše jen ne poklidné, jelikož planeta je zamořena agresivními mimozemšťany. Hráčův úkol spočívá v pomoci Brotatovi přežít vlny útoků do doby, než se objeví záchrana.
Brotato je frenetická top-down arénová střílečka s rogue-lite mechanikami, v níž se hráči pokusí ubránit čím dál obtížněji zvládnutelným vlnám nepřátel útočících ze všech stran, přičemž Brotato defaultně útočí automaticky a hráč se stará o míření a pohyb napříč arénou. Jednotlivé vlny trvají většinou do minuty a mezi nimi si hráč může oddechnout a nakoupit za získané peníze zbraně a předměty, dávající postavě nové bonusy, ale i omezení. Postupně hráč získává zkušenostní body pro vylepšování a odemyká si nové charaktery s unikátními vlastnostmi a stylem boje, kteří v kombinaci s širokou škálou vybavení zaručují vysokou variabilitu hraní.