Metroid Prime 2: Echoes

Nájemná lovkyně Samus Aran je Galaktickou federací poslána zachránit jednotku vojáků sloužících na lodi nacházející se poblíž planety Aether, obývané rasou Luminoth. Po příjezdu zjišťuje, že vojáky napadla rasa Ing původem z Aetheru v alternativní temné dimenzi. Aby zastavila Ing, musí v temném Aetheru navštívit tři chrámy ukrývající světlo Aetheru a zachránit rasu Luminoth. Pronásleduje ji ovšem její temné dvojče Dark Samus, které vzniklo při její poslední misi na planetě Tallon IV...

Hlavní změnou v hratelnosti oproti předchozímu dílu série je existence dvou paralelních dimenzí Light Aether a Dark Aether, mezi kterými je nutno přepínat, protože změny v jedné dimenzi ovlivňují dimenzi druhou a někdy lze cestu pro postup dál otevřít jen v jedné z nich. Temný Aether je pro Samus o poznání nebezpečnější než světlý a je nutné se pohybovat pouze v bezpečných zónách, které je potřeba nejdříve aktivovat a mimo které Samus rychle umře.

Echoes je také první hrou v sérii nabízející multiplayer až pro čtyři hráče na jedné konzoli ve splitscreenu. K dispozici jsou dva mody, klasický deathmatch a Bounty, ve kterém je cílem sbírat mince vypadávající z poškozených hráčů.

Zakončení Prime trilogie vyšlo v roce 2007 na konzoli Wii s podtitulem Corruption.