Metroid Fusion

Nájemná lovkyně Samus Aran je vyslána Galaktickou federací na další misi na planetu SR388, dějiště druhého dílu série, Return of Samus. Zde je nakažena parazitem X, ale doktoři Federace ji zachrání pomocí vakcíny z metroidí DNA, díky které nově může absorbovat X parazity za cenu odstranění většiny jejího obleku, což mimo jiné znamená ztrátu většiny schopností a mnohem nižší odolnost proti poškození. Krátce poté je Samus poslána vyšetřit nevysvětlenou explozi na biologické výzkumné stanici, kam byly posláni chycení paraziti X a infikované části její zbroje. Stanice je však liduprázdná a kompletně ovládaná parazity X a aby toho nebylo málo, jeden z parazitů se zhlédl v samotné Samus a vznikla tak nebezpečná SA-X. Boj o přežití začíná.

Čtvrtý díl hlavní Metroid série se ve větší míře než předtím soustředí na příběh, který je poprvé vyprávěn pomocí cutscén a textových brífinků. Ve hře se také objevují navigační místnosti, které na mapě označují váš současný cíl. Kromě toho nijak nevybočuje z formátu daného předchozími díly kromě malých změn jako nové schopnosti Samus, mezi které patří například ledové rakety Ice Missile a Diffusion Missile, rakety s větším rádiusem výbuchu.

Dlouhých 19 let po vydání na hru navázal Metroid Dread.