Remake The Legend of Zelda: Ocarina of Time, určený pro handheld Nintendo 3DS. Kromě důkladného grafického faceliftu nabízí pohodlnější ovládání a interface (díky dvěma displejům 3DS je snadnější používání předmětů, je také možné mířit a pohybovat kamerou použitím gyroskopického pohybového ovládání) a systém nápověd v podobě vizí ukrytých v kamenných monolitech. Jinak zůstala hratelnost kromě drobných balančních úprav zachována v původní podobě.

Kromě základní hry nabízí Ocarina of Time 3D dva speciální mody - prvním je Master Quest, těžší a zrcadlově obrácená verze hry s předělanými dungeony, která na N64 vyšla jako samostatný disk a druhým je Boss Challenge, ve kterém může Link znovu a na čas bojovat s jednou již poraženými bossy. Po prvním opětovném poražení všech bossů se odemkne Boss Gauntlet, jehož cílem je porazit všechny bossy v jedné sekvenci bez použití léčivých předmětů.