Pokračování Pokémon Pinball na handheld Game Boy Color a druhá pinballová hra s tématikou série Pokémon. Oproti prvnímu dílu v ní najdete i Pokémony druhé a třetí generace.
Jak už název napovídá, nabízí dva stoly – Ruby a Sapphire, tématicky vycházející ze stejnojmenných pokémoních RPG třetí generace. Stoly se kromě rozvržení liší i chytatelnými Pokémony. Hratelností jde o klasickou pinballovou hru, kde ale odměnou za plnění všemožných miniher a výzev kromě skóre jsou různí Pokémoni, kterých je 200 a které si přidáváte do svého Pokédexu.
Hra neobsahuje multiplayer, poskytuje ale možnost vyměňovat Pokémony a highscore skrz GBA Link Cable.