Darkseid napadol Metropolis a chce uniesť jeho obyvateľov, aby si ich zotročil vo svojom podzemnom úkryte. Na pomoc však prichádza Superman, aby zachránil situáciu a zahnal zákerného zlosyna tam, odkiaľ prišiel.
Superman: The Game je hra určená pre dvoch hráčov, ale dá sa hrať aj formou singleplayeru. Rozdelená je do šiestich sektorov, pričom tri sú ulicami Metropolisu a tri Darkseidove podzemie. Cieľom je zachrániť alebo uniesť, v závislosti za ktorú postavu hráte, čo najviac obyvateľov mesta. K tomu vám pomôžu usmerňovače, ktoré sú rozložené rôzne po mape. Tie musíte nastaviť tým smerom, ktorým chcete, aby vám občania utekali.
K tomu môžete použiť aj špeciálne schopnosti svojich postáv. Superman dokáže lietať, Darkseid sa vie zase teleportovať. Rovnako môžete používať aj svoje útočné schopnosti, aby ste dostali životy toho druhého na nulu. Aj Supermanov laserový zrak, aj omega lúče Darkseida sa odrážajú od usmerňovačov. Všetky sektory sú delené minihrou v bojových zónach, kde buď prelietavate úzkymi chodbami alebo sa snažíte vyhnúť útokom.