Hra je založena na komiksové sérii Rogue Trooper. Na planetě Nu-Earth zanechala věčná válka probíhající mezi Severem a Jihem zemi zdevastovanou. Jižané vytvořili svoji novou a silnou zbraň - geneticky upravené vojáky nazvané G.I. (Genetic Infantrymen), kteří jsou schopni obstát v těžkých podmínkách zničeného prostředí. Ovšem na jejich první misi jsou zrazeni a útok přežije jen jeden voják, který je rozhodnut najít zrádce a pomstít své padlé spolubojovníky Helma, Gunnara a Bagmana, kteří "přežili" pouze v podobě biočipů.
Hráč ovládá vojáka, jehož cílem je najít osm videokazet, které mu mají pomoci k usvědčení zrádce. Ty jsou rozmístěné různě po světě a při jejich hledání naráží hráč na nepřítele, a to jak na vojáky, tak na bunkry se střílnami. Munici a stejně tak lékárničky je nutné sbírat a ačkoliv je geneticky upravený voják více odolný, tak průchod přes určitý terén mu automaticky snižuje jeho zdraví, na což je třeba dávat pozor.
Na horní části obrazovky je umístěna minimapa okolí a ukazatele zdraví a zásob v inventáři. Také jsou zde umístěné čipy spolubojovníků, kteří tu a tam komentují herní situaci a jsou tak přítomni s hráčem.
Roku 2006 vyšla modernější verze Rogue Trooper.