Úlohou hráča v akčnej arkáde Base Squad 49 bolo ochrániť základňu pred vlnami nepriateľov. Tých predstavovali zombíci a mutanti rôznych veľkostí a s rôznou odolnosťou. Hráčovi pri strieľaní pomáhala aj dvojica guľometov na oboch stranách základne. Zabíjaním nepriateľov bolo možné získavať peniaze na nákup zbraní, vylepšenia základne a steny, spomaľujúce postup netvorov. Po zabití niektorých nepriateľov zostala na mape hviezda, ktorá dala hráčovi na krátku dobu do rúk silnejšiu zbraň. Hra bežala na engine Unity.
Base Squad 49 sa po vydaní Early Access verzie v máji 2016 dočkal iba dvoch updatov a o mesiac bol Valve kvôli zneužitiu systému Steam Trading Cards stiahnutý z predaja.