Zatímco Američané měli svůj Shadowrun z roku 1994 a o rok dříve pak vyšla verze Shadowrun od australského studia Beam Software, tak i Japonci se dočkali své verze hry Shadowrun. Příběh této hry je založen na románu Shadowrun Replay a odehrává se v Neo Tokiu v roce 2053. Sleduje příběh party čtyř značně odlišných postav, jako je samurai Rikudo, šamanka Mao, decker D-Head a Shiun, bývalý člen vlivné korporace, kteří dostanou první úkol. Jedna část města totiž hlásí výskyt nebezpečného bojovníka a tato parta je vyslána, aby ho vypátrala a zabila, čímž začíná jejich dlouhý příběh.

Část, ve které hráč prozkoumává dané místo, se hraje jako adventura. Používají se příkazy k tomu, aby postavy danou lokaci prohledaly a promluvily si s lidmi. A protože se jedná o jRPG, tak jsou zde i dungeony a tahové souboje. Ty se odehrávají na samostatné obrazovce, která je rozdělena mřížkou. Ta ukazuje, kam se postavy hráče mohou pohnout, takže je možné buď zaútočit zbraní na blízko, nebo naopak poodejít a zaútočit na dálku. Při každém útoku či obraně hráče před nepřítelem se ukáže na obrazovce hrací kostka a hráč její rotaci zastavuje stiskem tlačítka. Číslo hodu pak určuje sílu útoku nebo to, jak se postava útoku brání. Ve hře jsou dva důležité ukazatele, kdy jeden je označen jako zdraví a druhý jako mental a každý z nich je ovlivněn jinými typy útoků. Nepřátelé jsou na mapě viditelní.