Secret Agent HD je moderní verzí klasické plošinovky Secret Agent od Apogee Software. Hra má přepracovanou grafiku do vysokého rozlišení a změněnou paletu barev, ale zachovává původní hratelnost a vizuální styl. Příběhové obrazovky jsou nyní animované a nově hra obsahuje i soundtrack, který nebyl v původní verzi přítomen. Původní úroveň obtížnosti (zde označena jako "normal"), byla doplněna i o "easy" (hráč má o jeden život navíc a nepřátelé vydrží méně zásahů) a "hard" (hráč má o život méně a ve hře se vyskytuje menší počet munice).

K původním třem epizodám přibyla i čtvrtá s šestnácti úrovněmi. Součástí hry je navíc editor úrovní, které je po vytvoření možné sdílet s ostatními. Nové úrovně lze jednoduše stahovat a hrát přímo z herního menu. Díky podpoře online žebříčků je možné porovnávat své skóre s přáteli. Nové jsou i statistiky všech možných herních činností. Hra také podporuje achievementy a ukládání do cloudu.