Stejně jako v prvním díle se i tentokrát hráči opět ujmou role Tima Goodmana a spolu s pomocí detektiva Pikachu, budou řešit záhady spojené se soužitím pokémonů a lidmi v Ryme City. Součástí příběhu pak bude i odhalení původu pokémoního detektiva.

Hratelnost zhruba odpovídá prvnímu dílu a skládá se ze sběru stop a důkazů, rozhovoru s herními postavami a dedukce vedoucí k rozluštění série záhadných incidentů. Je však jisté, že ve hře se vyskytují také pokémoni z nově vydaných her hlavní série.