Třetí část série Da Capo nás znovu zavede na ostrov Hatsunejima. Zhruba tři desetiletí po konci druhého dílu je údajně neustále kvetoucí třešeň minulostí. Kouzelný strom už několik desetiletí nevykvetl a neplní tedy žádná přání. Lidé pomalu zapomínají na záhadné události z minulosti a žijí poklidný každodenní život. Platí to i pro středoškoláka Yoshino Kiyotaku. Společně s pěticí dívek z jeho školního klubu se rozhodne, spíše jen pro pobavení, u nevykvetlé třešně tajně vyřknout své přaní. Strom náhle vykvete a všichni zároveň dostanou na mobil textovou zprávu pocházející z roku 1951. Rozhodnou se tajemné zprávě přijít na kloub.

Da Capo III původně vyšla v Japonsku již roku 2012. Její, obsahově rozšířené, vydání s názvem Da Capo III R bylo přeloženo do anglického jazyka až o pět let později a je dostupné ve dvou verzích. Da Capo III R X-Rated je stejná jako japonská verze, zatímco Da Capo III R má odebrány erotické scény.