Roku 2099 napadnou sluneční soustavu mimozemštané rasy Drak-Sai s cílem vyhubit lidstvo. Po útoku na Zemi chtějí použít svou zbraň zvanou „Sun Dagger“ na Slunce a spustit tak supernovu, která zničí všechen život v blízkosti. Jakožto pilot pozemské letky musíte této katastrofě za každou cenu zabránit.

Total Eclipse se nese ve stylu rail shooter vesmírné střílečky, připomínající spíše hry z žánru shoot 'em up. Pohyb je tak omezen pouze na strany, přičemž loď sama letí kupředu. Hráč se snaží ničit nepřátelské lodě, stavby a další nástrahy pomocí zbraní, které je možno během hraní vylepšovat sběrem power-upů až na tři možné úrovně pro každou z nich. O vyprávění příběhu se starají předrenderované cutscény.

PlayStation verze s podtitulem Turbo se od původní hry pro 3DO liší pouze zvýšenou rychlostí a možností použití kódů pro výběr úrovní.