Hráč se ujímá velení na mezinárodní vesmírné stanici. Dohlíží na posádku, dává jejím členům rozkazy v oblastech výzkumu, cvičení, oprav stanice, i co se plánování a náplně jejich volného času týče. SpaceStationSim se tak tímto vzdáleně podobá například hře Space Colony, ovšem její grafika je plně ve 3D.

Jako zodpovědná osoba se hráč musí postarat o to, aby si členové posádky zachovali své fyzické i duševní zdraví. Toho dosáhne jejich správným zásobováním různými životními nezbytnostmi, i smysluplnými činnostmi, které jim v průběhu hry přiděluje. Vesmírná stanice jde totiž vzhledově i prakticky proměňovat, a to pomocí nových komponentů a modulů.