Jak už název napovídá, Pokkén je kombinací sérií Tekken, ze které si bere hratelnost a vývojářský tým, a Pokémon, ze které si bere reálie. Jedná se tedy o 3D bojovou hru se známými příšerkami Pokémony v hlavní roli.

Na výběr je z 16+ Pokémonů (záleží na verzi hry), mezi kterými nechybí takové stálice jako Pikachu či Charizard, ale najdou se mezi nimi i zástupci novějších generací jako maskot čtvrté generace Lucario či ohnivý startér z šesté generace Braixen. Při zápasech je také možnost využívat pomoci od 30+ podpůrných Pokémonů, poskytujících všemožné výhody a speciální útoky.

Souboje probíhají v kruhové aréně a jsou rozděleny do dvou fází – první je Field Phase, ve které je nutné strategicky manévrovat kolem protivníka a ve vhodných momentech útočit, čímž se můžete přepnout do Duel Phase, ve které se kamera přesune do pohledu z boku jako v klasických mlátičkách. Úspěšné útoky a obrana nabíjí tzv. Resonance Gauge, jejíž naplnění aktivuje Burst Mode, ve kterém Pokémoni dostanou přístup k ničivým útokům a vybraní mohou aktivovat Mega Evolution.