Jak již název napovídá, Lunar: Sanpo-suru Gakuen spadá do početné série Lunar, nicméně v tomhle handheldovém titulu se podíváme stovky let před události ze hry Lunar: The Silver Star (1992). Příběh začíná ve městě Burg, které bude znalým série jistě dobře známé. Žijí zde dívky Ellie a Lena, které již mají dost rolnického života a zapíší se na nově otevřenou kouzelnickou školu na ostrově Ien. Nicméně když zde dorazí spolu s dalšími studenty, tak zjišťují, že je škola naprosto prázdná a v dohledu není jediný učitel. Je teď na nich, aby záhadě přišly na kloub.

Hratelností se jedná o poměrně běžné 2D JRPG, které dělá samozřejmě jisté ústupky své konzoli. Z top-down pohledu budete svou partu provádět mapou, zkoumat dungeony a bojovat v náhodných soubojích v tahové formě. Za vyhrané souboje lze získat zkušenosti a ty pak klasicky odemykají nové dovednosti.

Hra vyšla pouze v Japonsku a stejně tak tomu bylo i s remakem pro Segu Saturn, který nese název Mahou Gakuen Lunar!