Ve hře se hráč octne v roli Atahualpy, pyšného mladíka, který má zachránit starobylý a slavný národ Inků před španělskými dobyvateli. Jeho otec El Dorado ho vezme na setkání starších; zde se dozví, že Lord Aguirre se snaží impérium Inků ovládnout pomocí asteroidu a Atahualpovým úkolem bude Aguirrovi v tom zabránit. Jediným způsobem, jak ho porazit, je dosáhnout vítězství se svým vesmírným korábem.

Inca II: Wiracocha je pokračováním sci-fi adventury Inca z roku 1992, která byla považována za jednu z nejoriginálnějších adventur své doby. Hra znovu kombinuje adventurní hratelnost s logickými hádankami a akční vesmírnou střílečku. I přes nevyváženou obtížnost hra disponuje na svou dobu nadprůměrným audiovizuálním zpracováním i grafikou.

V USA byla hra vydána pod názvem Inca II: Nations of Immortality.