Děj hry se odehrává v alternativní realitě, ve které je Tokio napadeno zástupy démonů a lidstvo se s nimi pokouší bojovat. Protagonista hry žije v podzemí a podstupuje trénink, na jehož konci se má stát lovcem démonů. Ti využívají k boji s démony speciální programy. Jenže jednoho dne se jeden z těchto programů pokazí a hráč je vržen do světa démonů a je nucen s nimi bojovat.

Giten Megami Tensei je jedna z mnoha odboček Megaten série a podobně jako ve hrách Megami Tensei, tak i zde hráč tráví část herní doby procházením 3D prostředí z pohledu první osoby. Nepřátelé jsou na obrazovce viditelní ještě předtím, než boj začne, a někdy je hráč i nepřítelem napaden při průzkumu. Boje probíhají v reálném čase, ale hra se zapauzuje ve chvíli, kdy hráč vybírá z menu rozkaz, který dá své postavě (ve stylu ATB systému ze série Final Fantasy).

Verze pro PC má pak vylepšenou grafiku a herní interface si lze do určité míry upravit.