Ve hře Gateways se v roli vědce vydáváte na průzkum tajemných věděckých laboratoří, ke kterému vám budou sloužit vaše vynálezy zvané gateway guns. První dostupný typ vytváří portály podobně jako ve hře Portal, časem ale získáte další vynálezy, které vám umožní například procházet skrz stěny nebo se dokonce vracet v čase.

Hra se odehrává na jedné rozlehlé mapě, takže se vyhnete nahrávacím obrazovkám při přechodu do další oblasti. Při prohledávání laboratoří budete nacházet stále nové vynálezy, které budete potřebovat, abyste se dostali na místa, která bez nich jsou nedostupná. K vyřešení hlavolamu můžete využít terminály společnosti Gateway, které vám dají nápovědu pro jejich vyřešení.