Edyta, hlavní hrdinka této hry, touží po dobrodružství, seznámení s novými lidmi a využití všech neomezených možností, jež se jí na prahu dospělosti nabízejí. Je už unavená ze svého života v zapadlé vesničce, kde se musí podřizovat zkostnatělému systému i očekávání ostatních. Chce být sama sebou. A tak se rozhodne osamostatnit a přestěhovat do metropole "City".

V "City" to však nebude mít lehké, na každého "cizáka" se totiž místní dívají skrz prsty. Edyta navíc pochází z rasy Dray, tzv. mechanicky augmentovaných lidí, kteří jsou odsouzeni žít na pokraji společnosti. Začne se tedy živit jako "Roof Runner" - kurýrka. Jejím posláním bude prohánět se po střechách a adresovat poštu, pokud možno rychle a nenápadně. Dnes si odbude svou premiéru. Uvidíme, jak to celé dopadne...

Clockwork City v sobě kombinuje prvky fantasy a steampunku a jde ruku v ruce s tradiční hratelností, typickou pro vizuální novely.