Hráč ovládá potápěče Kapitána Beeblea, ten musí v zatopeném jeskynním komplexu hledat krystaly a vracet je do speciální jednotky na zpracování krystalů (Crystal Processing Unit, neboli C.P.U.), která je umístěna na začátku úrovně. Získaný krystal musí dodat do 20 vteřin do C.P.U., jinak dojde k výbuchu. Je tedy potřeba si předem připravit i cestu zpět.

V jeskyních může kapitán narazit na pasti nebo na podvodní tvory, po kterých může střílet ze své zbraně. Pokud jej ale past nebo tvor zasáhne, přichází o jeden z pěti životů. O ten přijde i v případě, že mu dojde jeho palivo, které spotřebovává jeho oblek při každém pohybu.