St. Thomas je obchodně-diplomatická strategie, jejíž název upomíná na stejnojmenný karibský ostrov, na kterém se také celá hra postupně odvíjí. Vaším úkolem bude ovládnutí celého ostrova, jeho obyvatel a guvernérů jednotlivých oblastí, k čemuž využijete veškeré vojenské, obchodní a diplomatické dovednosti.

Hru začínáte s jedinou lodí a jediným městečkem na nejnižším z 10 stupňů hodností, kterých lze ve hře dosáhnout. Zpočátku lze pouze úspěšným obchodováním udržet obyvatele města v dobrém rozmaru, postupně vytvoříte větší loďstvo, město necháte opevnit a obyvatel bude přibývat. Šikovnou politikou si vytvoříte vlastní vztahy k okolním guvernérům a můžete najmout piráty, kteří vám pomohou v postupu nahoru. Hra vám umožní jakkoliv intrikovat a průběh mohou ovlivnit i přírodní katastrofy v podobě výbuchu vulkánu nebo větrné smrště.