Planeta Země pomalu, ale jistě, ztrácí svou schopnost udržet na svém povrchu život a lidské populace raketovým tempem ubývá. Společnost Seed Industries pracuje na několika způsobech zachování lidského druhu včetně možnosti mezihvězdného cestování a teraformace nových světů. Brzy jsou na nové exoplanetě vysazeni první osadníci, kteří zde postupně vytvářejí nový domov pro lidstvo.

Seed je sandboxová MMO simulace, jejíž pravidla si tvoří sami hráči. Základním kamenem hratelnosti je ekonomika zahrnující těžbu a zpracování surovin, výrobu i prodej všemožných, pro přežití podstatných produktů. Podstatné je, že všichni hráči jsou nějakým způsobem do obchodu zapojeni. Politický či sociální aspekt hry tkví v tvorbě různých komunit, které si mohou rozhodovat o způsobu vlastního fungování. Mezi komunitami existují úzké vazby, skupiny mezi sebou mohou obchodovat, přátelit se či vést konflikty.

Každý hráč se může starat o potřeby až deseti postav současně, může mezi nimi tvořit různé vazby a vytvářet celé rodiny. Žádná fiktivní postava však ve hře není trvale, ale postupně stárne a jeden reálný týden odpovídá celému jednomu roku ve hře.