Saboter je akční plošinovka, v níž se hráč stává rozvědčíkem, infiltrujícím nepřátelské zařízení. Cílem je aktivovat atomové samodestrukční zařízení, jenž lze aktivovat jedním ze čtyř kódů. K těm se hráč musí napřed dostat, přitom si však musí dávat pozor na nepřátele a automatické kulomety, střežící důležité části komplexu. Nepřátele lze zabít, ale kulomety je možné vyřadit pouze zničením řídící centrály. Hráč může nalézt různé předměty, jež zahrnují zbraně či klíče k otevření dveří. Po spuštění atomového zařízení stačí opustit komplex a hra končí.