Rhem 3 je přímým následovníkem předcházející adventury Rhem 2: The Cave (2005) a jde znovu o nelineární zkoumání tajemného světa v pohledu vlastních očí. Neznámé prostředí plné zvláštních zařízení, prapodivných přístrojů a komických dopravních prostředků před vás klade jeden logický problém za druhým, z nichž některé vám pomohou vyřešit i předměty umístěné do inventáře.

V úvodu vás přivítá dopis bratrů Kalese a Zetaise, jimž znovu neodmítnete pomoc a vydáváte se na průzkum další části podzemního komplexu Rhem. Tyto prostory ukrývají někde ve svém nitru tajemný artefakt, kterým je černý krystal nevídané hodnoty. Cestu ke krystalu vám pomohou nalézt vodítka a informace v tajné knihovně a pomoc zvláštních obyvatel podzemí.