Ve hře International Superstar Soccer 64, budete mít na výběr z 36 reprezentačních výběrů. Můžete se s nimi pustit do exhibičního zápasu, do ligy Inter-National, která probíhá nejprve formou skupin po třech týmech následované vyřazovacími boji. Další možností je zahrát si World League, ve které budete se svým týmem hrát 70 ligových zápasů. Přístupné jsou rovněž scénáře, ve kterých půjdete do zápasu v určitém čase a za určitého skóre, kdy bude cílem změnit osud utkání. K dispozici je připravený i trénink, ve kterém můžete zkoušet různé taktiky a samostatným režimem jsou pak penaltové rozstřely.

Ve hře si můžete nastavit délku poločasu od tří do sedmi minut. Na výběr je také pět režimů obtížnosti. Součástí hry je i multiplayer, který je až pro čtyři hráče.