Ve hře Hidden Expedition: Amazon se hráč ocitá v kůži člena týmu Utajená expedice. Úkolem je najít své kolegy ztracené v Amazonii.

Ve vlastní hře hráč na obrázcích hledá položky ze seznamu zadaného před začátkem mise. Součástí hry jsou nápovědy; každá část hry má v základu tři, další jsou zpřístupněny nalezením pětice brouků. Hra obsahuje minihry.

Titul je třetím dílem série Hidden Expedition; je sequelem Hidden Expedition: Everest a prequelem Hidden Expedition: Devil's Triangle.