Příběh se odehrává v neradostné budoucnosti roku 2048, kdy po vlně ekologických katastrof, klimatických změn a propadů ekonomiky je většina Američanů nucena žít ve stále se rozrůstajících městských aglomeracích. Všudypřítomná chudoba a korupce vedou k růstu kriminality a sociálních nepokojů, čemuž napomáhá i nová, extrémně silná droga známá Shard, rychle se šířící podsvětím. Když je nalezena mrtvola nového velitele policejního sboru a z vraždy obviněn oblíbený komunitní vůdce, spousta lidí v tom vidí nějakou levotu. Na místo nastupuje trojice hrdinů, aby rozpletli nitky tajemného spiknutí.

Disjunction je kyberpunkové akční RPG z horního pohledu, vyvedené v pixelartovém provedení. Hráč se ujímá celkem tří hratelných postav s vlastními schopnostmi, vylepšeními a talenty - soukromého detektiva Franka, pomstou poháněného bývalého boxera Joea a hackerku s přezdívkou Spider. Hráč si v průběhu hry může zvolit buď cestu přímého násilí nebo kradmý postup, kdy přichází ke slovu stealth a plížení ve stínech. Tomu odpovídá i rozsáhlý zbraňový arzenál, kybernetické implantáty a doplňky umožňující jak krvavé prostřílení se úrovněmi, tak tichou pacifikaci protivníků bez ztráty na životech. Důležitou součástí hry jsou i volby, jež hráč v klíčových momentech učiní s reálnými dopady na další vývoj děje.