Rok 2063, Země vstoupila do Galaktické aliance na podporu obchodu, sdružující i mimozemské civilizace. Lidstvo očekává sociální stabilitu a ekonomickou i politickou prosperitu. Nick Delios, bývalé soukromé očko a nyní tajný vládní agent, je obviněn z pokusu o vraždu Annity Argyriou, prezidentky mocné společnosti Detronics. Nick se snaží najít pravého pachatele a při odhalování pravdy se ocitá v kleštích rozsáhlé konspirace napříč celou Galaktickou aliancí, která ohrožuje nejen jeho samotného, ale i celou Zemi.

Hra navazuje na předchozí Conspiracies z roku 2003. Příběh se odehrává několik měsíců po událostech první části a nabízí dvě různá zakončení. Nick v pohledu vlastních očí cestuje při řešení zamotaného případu i mimo Zemi. V průběhu hry s 12 úrovněmi vyřeší řadu 3D puzzlů a hádanek založených na práci s inventářem. Graficky hra znovu využívá 3D předrenderovaná prostředí, do kterých umísťuje živé herce.