Itálie, rok 1492. Mnich a současně ranhojič Basilius Valentius je z kláštera Camaldoli povolán do Florencie, aby se pokusil pomoci svému dávnému příteli Lorenzovi Medicejskému, který trpí záhadnou chorobou. Krátce po příjezdu však Lorenzo umírá. Basilius nachází důkazy o vraždě, které jej vedou do Říma. Zde mu při vyšetřování pomáhá vlivný Rodrigo Borgia, přičemž na světlo vychází šokující skutečnosti, které vedou do středu několika nejmocnějších italských rodinných dynastií.

Borgia je adventura vytvořená na základě známého stejnojmenného televizního seriálu, která hráče zavede do řady autentických lokací Říma a Florencie 15. století v ručně kreslené grafice. Na příběh jsou napojeny logické hádanky, minihry a hledání skrytých předmětů, včetně interaktivních rozhovorů a cutscén.